Proteínas Asociadas a la Respuesta a Phytophthora en Cacao: Análisis Bioinformático Comparativo para el Control Biológico

Resumen

Phytophthora spp. representa una de las principales amenazas fitosanitaria para los sistemas agroforestales de cacao, provocando pérdidas superiores al 40%. Este estudio realizó un análisis comparativo bioinformático con el fin de identificar proteínas asociadas a mecanismos de resistencia en Arabidopsis thaliana, Theobroma cacao L. y Herrania umbratica. A partir de 91 secuencias iniciales de Arabidopsis se identificaron 20 genes vinculados con la defensa vegetal. Las secuencias proteicas se analizaron mediante BLASTX, seleccionándose aquellas con valores E ≤ 1e‑10, coberturas adecuadas e identidades superiores al 65%. Posteriormente, estas proteínas fueron comparadas con los genomas de T. cacao y H. umbratica mediante BLASTP,  lo que  permitió  detectar homólogos  funcionalmente relevantes. El análisis ortólogo con OrthoVenn3 mostró 13 proteínas conservadas entre las tres especies, destacando receptores tipo lectina, factores de transcripción (bZIP60, NAC089), proteínas de estrés (PHOS32) y componentes clave de señalización como FLS2, RBK1 y RPH1. Los análisis filogenéticos evidenciaron una estrecha relación evolutiva entre T. cacao y H. umbratica, junto con divergencia esperada respecto a Arabidopsis, aunque con conservación funcional de rutas inmunes esenciales. Estas proteínas conservadas representan candidatas clave para estudios funcionales y su potencial aplicación en programas de mejoramiento genético orientados a fortalecer la resistencia del cacao frente a Phytophthora spp. Los resultados confirman el valor del enfoque in silico para acelerar la identificación de genes defensivos y promover sistemas de producción más resilientes y sostenibles.